Il settore degli Archivi è notevole sia per la quantità che per la qualità del materiale documentario conservato e comprende:
- L'Archivio Storico Comunale
- L'Archivio Spontini
- L'Archivio Ubaldini
- L'Archivio Edmondo Marcucci
- L'Archivio Pianetti
- L'Archivio Azzolino
- L'Archivio Colocci Vespucci
- L'Archivio degli II.RR.B.
- Gli Archivi Balleani
- L'Archivio Camerata
- Gli Archivi delle tipografie jesine
- Gli Archivi Honorati e Honorati Trionfi
- L'Archivio Pacifico Carotti
- L'Archivio della Sacsa di Jesi
- L'Archivio Nappi
- L'Archivio Ghislieri
Come riportato anche nella Dichiarazione Universale sugli Archivi (Oslo 2010), gli archivi costituiscono un patrimonio unico e insostituibile e sono fonti affidabili di informazione, contribuendo alla costituzione e alla salvaguardia della memoria individuale e collettiva: l'accesso ad essi arricchisce la nostra conoscenza della società umana.